153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1910 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 520 aa  1023    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  42.19 
 
 		 484 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  25.11 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.21 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.43 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.43 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.97 
 
 		 503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.97 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.97 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 503 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.68 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.61 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 		 508 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.78 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.16 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 507 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.84 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.15 
 
 		 493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.98 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 510 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  27.09 
 
 		 501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.18 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  27.68 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.59 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  27.5 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  25.54 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 508 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  25.32 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.54 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.99 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 510 aa  90.1  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 494 aa  90.1  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 575 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.08 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.87 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  26.77 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.44 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.44 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>