127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1083 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  100 
 
 
467 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  36.56 
 
 
415 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  34.08 
 
 
437 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 
432 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  25.29 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.6 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.6 
 
 
492 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.6 
 
 
492 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.6 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.6 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.3 
 
 
492 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.6 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
492 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.98 
 
 
503 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.98 
 
 
510 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.98 
 
 
510 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.98 
 
 
510 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.98 
 
 
510 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
510 aa  86.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.17 
 
 
477 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 
502 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  26.69 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
503 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.31 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
507 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.36 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.19 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
520 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.53 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
484 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 
494 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.56 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
492 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.74 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
502 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24.36 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 
487 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
484 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
515 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 
491 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 
465 aa  60.1  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 
446 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  24.6 
 
 
501 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
508 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 
484 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.36 
 
 
501 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.43 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.43 
 
 
475 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.6 
 
 
483 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
471 aa  56.6  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  24.41 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.47 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.01 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.4 
 
 
502 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.51 
 
 
506 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
499 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.14 
 
 
504 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.52 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>