141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3901 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
498 aa  949    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 
509 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  35.65 
 
 
533 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  35.03 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.56 
 
 
508 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 
490 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 
503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.83 
 
 
483 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 
486 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.03 
 
 
505 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.26 
 
 
492 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
492 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
502 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.04 
 
 
492 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.04 
 
 
492 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.2 
 
 
492 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.2 
 
 
492 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.2 
 
 
492 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.43 
 
 
492 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
483 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.7 
 
 
492 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
487 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
484 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 
507 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
508 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 
484 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  28.48 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  29.91 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.32 
 
 
510 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.32 
 
 
510 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.32 
 
 
510 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.32 
 
 
503 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.32 
 
 
510 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
500 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  27.42 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.84 
 
 
501 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
490 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.51 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.75 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  28.52 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.2 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.25 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.25 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 
502 aa  67  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  27.08 
 
 
504 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
503 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 
520 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
484 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
498 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 
488 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 
493 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  19.11 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
491 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.49 
 
 
467 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.3 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
504 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 
479 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
482 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 
515 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  24.07 
 
 
488 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
423 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.11 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
502 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  27.6 
 
 
504 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
471 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>