107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02464 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  100 
 
 		 488 aa  974    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  55.28 
 
 		 484 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 490 aa  97.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 494 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.49 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.49 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.31 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.84 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 508 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  21.16 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.52 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.33 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  21.88 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.72 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  20.85 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  19.29 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  22.12 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  21.85 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.12 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  23.32 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.85 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.85 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.85 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.35 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.2 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.2 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.58 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.01 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.01 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.58 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.83 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.13 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  19.63 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.23 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 467 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  18.91 
 
 		 508 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  21.1 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 520 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.82 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>