95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2291 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  916    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.21 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  29.34 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.98 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.33 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.43 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.17 
 
 		 501 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  24.4 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.03 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.03 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.33 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  19.47 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  20.43 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  25.33 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  25.25 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 507 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.24 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.24 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.24 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.24 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.24 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 		 530 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.25 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.97 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  19.75 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  19.17 
 
 		 492 aa  51.2  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 493 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 509 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.93 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.74 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0248  hypothetical protein  21.59 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.01 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.3 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 432 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>