126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1044 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  985    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  45.36 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  44.58 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  34.74 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  35.16 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  31.05 
 
 		 500 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 475 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.22 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.74 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.22 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.7 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.7 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.02 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.7 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.7 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  26.32 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.49 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.77 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.93 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.77 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.77 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.51 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.51 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.51 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.05 
 
 		 479 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.51 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 490 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.62 
 
 		 510 aa  67  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 510 aa  67  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.14 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.94 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  24.72 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.08 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.3 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.32 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.61 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 502 aa  57  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  22.98 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.18 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 504 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  28.46 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>