145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3128 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  88.01 
 
 
493 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
493 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  37.55 
 
 
508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  35.16 
 
 
506 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  36.08 
 
 
497 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 
471 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  30.75 
 
 
500 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
500 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 
502 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.49 
 
 
510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.09 
 
 
492 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.49 
 
 
510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.49 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.49 
 
 
510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.49 
 
 
510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.7 
 
 
492 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.91 
 
 
492 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.51 
 
 
492 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
487 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.7 
 
 
492 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.7 
 
 
492 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.7 
 
 
492 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
492 aa  107  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.7 
 
 
492 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 
479 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
488 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
504 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 
476 aa  94  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.27 
 
 
483 aa  93.2  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  28.3 
 
 
455 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  23.99 
 
 
501 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
465 aa  90.9  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.2 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.12 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.12 
 
 
474 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
487 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
504 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
475 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.08 
 
 
501 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  23.94 
 
 
493 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
497 aa  87  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.69 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.15 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 
477 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.86 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
507 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
471 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.86 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
483 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
490 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.57 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
490 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
500 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
509 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.92 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.55 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  26.05 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.21 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.35 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
491 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
482 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  22.26 
 
 
502 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 
533 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  22.96 
 
 
497 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>