144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3680 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 515 aa  998    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  37.78 
 
 		 502 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  32.2 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  33.22 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  28.39 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  29.58 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 489 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  25.75 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  25.75 
 
 		 475 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 483 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  28.06 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  26.35 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  26.76 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  26.76 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  26.76 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  26.76 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  26.76 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.65 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  26.76 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.72 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  28.42 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  25.21 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  25.21 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  25.21 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.85 
 
 		 501 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  30.79 
 
 		 503 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  26.05 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  26.05 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 488 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 508 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.95 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  25.6 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 504 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.33 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  23.82 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 499 aa  97.8  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 421 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 502 aa  94.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  21.67 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 480 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  20.9 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  27.67 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  29.36 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.73 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  19.18 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.86 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.88 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0248  hypothetical protein  27.67 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>