125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3847 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  100 
 
 		 437 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  95.82 
 
 		 432 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  75.61 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  34 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.72 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.32 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.79 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.79 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.02 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.02 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.06 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.08 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20.76 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.79 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.72 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  24.3 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  22.99 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.17 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.44 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.67 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.63 
 
 		 508 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.08 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  21.41 
 
 		 455 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.05 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.05 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.97 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 507 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 509 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4090  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.291597  normal  0.0803273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  22.58 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  19.05 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  23.62 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  22.42 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>