160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1963 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  100 
 
 		 493 aa  986    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  46.15 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  28.72 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  28.72 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  31.1 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  31.1 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  30.42 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  28.51 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  28.51 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  28.72 
 
 		 503 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  31.1 
 
 		 492 aa  256  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  31.1 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  31.1 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  31.1 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  31.28 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  30.38 
 
 		 492 aa  250  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 477 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.25 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  28.08 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  28.29 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  27.37 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  28.39 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 510 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  28.65 
 
 		 510 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.23 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 575 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 503 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 482 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 487 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  28.15 
 
 		 509 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.42 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.42 
 
 		 474 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 499 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  27.92 
 
 		 504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 423 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  27.3 
 
 		 479 aa  114  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 510 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 484 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  25.37 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.28 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.73 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.72 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.34 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 497 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 415 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.1 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.72 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.22 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>