135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1890 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 507 aa  971    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  32.1 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 502 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0248  hypothetical protein  27.97 
 
 		 487 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  28.24 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  28.24 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  27.81 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  28.24 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  28.24 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  28.24 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  27.81 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  29.97 
 
 		 493 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 510 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  27.06 
 
 		 503 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  26.63 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  29.56 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  28.66 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 507 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 487 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 490 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  26.97 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 477 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  28.05 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.11 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.87 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  20.99 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 484 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.76 
 
 		 501 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  28.31 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.04 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  27.41 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  30.66 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.28 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 504 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.74 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  26.3 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  25.81 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>