132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3839 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
507 aa  1013    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.67 
 
 
510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.67 
 
 
510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.67 
 
 
510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.67 
 
 
510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.67 
 
 
503 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.9 
 
 
492 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.9 
 
 
492 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.64 
 
 
492 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.64 
 
 
492 aa  100  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.64 
 
 
492 aa  100  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
492 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.64 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.64 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
507 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.18 
 
 
492 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23 
 
 
483 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  20.68 
 
 
483 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
503 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
489 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.06 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
494 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.18 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
510 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.1 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.17 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
504 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.74 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.29 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.29 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
500 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.91 
 
 
501 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.8 
 
 
501 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
490 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
504 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.19 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.71 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
483 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 
501 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 
498 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 
471 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  24.18 
 
 
455 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
514 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
520 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  18.7 
 
 
479 aa  60.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
484 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  26.2 
 
 
504 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
487 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 
502 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
507 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.19 
 
 
505 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  23.83 
 
 
496 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
482 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
497 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  20.06 
 
 
483 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.36 
 
 
502 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
503 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 
493 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 
509 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
486 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
415 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25 
 
 
508 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
465 aa  54.3  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.34 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  19.22 
 
 
482 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1380  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0611611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 
514 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
508 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 
504 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
575 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 
490 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>