146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3400 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  88.01 
 
 		 493 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 493 aa  962    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  37.07 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  34.74 
 
 		 506 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  35.28 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  35.54 
 
 		 471 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 500 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 500 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 502 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.69 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.85 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.39 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.23 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.62 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 479 aa  97.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 509 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 480 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  30.22 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.93 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.5 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.5 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  23.03 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.99 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.25 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.68 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.67 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.37 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.78 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.32 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.68 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.82 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  20.78 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.64 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20.06 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.51 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  22.28 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>