102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0998 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  897    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  36.18 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  35.04 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  31.88 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  30.86 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  30.66 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 500 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 493 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 493 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.31 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  27.83 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.85 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.02 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.72 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.55 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.43 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.43 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.43 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.43 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.43 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.68 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  23.74 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.33 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.04 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.09 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  21.04 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  21.04 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.04 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.04 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  22.55 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  20.75 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  20.75 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.61 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.6 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 503 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.27 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  18.29 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 508 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  21.41 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  38.81 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  19.26 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 533 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.34 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  20.29 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.16 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>