209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3446 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 444 aa  879    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  67.57 
 
 		 444 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  58.78 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  47.03 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  42.89 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  41.47 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  39.66 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  40.59 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  39.71 
 
 		 448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  37.32 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  41 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  33.09 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.43 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  26.42 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  24 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  24.03 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  23.53 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  24.04 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  23.92 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.91 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  23.14 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.44 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  23.23 
 
 		 473 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  22.55 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.98 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.44 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  27.72 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  21.04 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  21.04 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.22 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  20.75 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.71 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  18.83 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  22.43 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.29 
 
 		 490 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 506 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>