41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0862 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  80.82 
 
 
420 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  94.48 
 
 
418 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
418 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  95.22 
 
 
418 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  97.36 
 
 
418 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  99.28 
 
 
418 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  94 
 
 
418 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  99.28 
 
 
418 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  81.01 
 
 
420 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  81.49 
 
 
420 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  81.82 
 
 
444 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  82.06 
 
 
419 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  82.06 
 
 
444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  35.49 
 
 
438 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  32.32 
 
 
416 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  29.47 
 
 
422 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
440 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2278  PST family polysaccharide export protein  82.76 
 
 
67 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.608743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
444 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 
444 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 
426 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 
444 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  20.17 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
482 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
448 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
429 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>