177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1044 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
440 aa  871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  60.91 
 
 
440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  47.03 
 
 
444 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  45.5 
 
 
449 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  41.67 
 
 
451 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  44.5 
 
 
444 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  45.05 
 
 
444 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  43.03 
 
 
426 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  41.99 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  40.83 
 
 
448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  41.95 
 
 
444 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  36.56 
 
 
436 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 
441 aa  252  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  33.41 
 
 
482 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 
449 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 
429 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  32.92 
 
 
427 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
478 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
476 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  29 
 
 
476 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  25.72 
 
 
418 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  25.57 
 
 
418 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
418 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
420 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  25.72 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  26.47 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  26.47 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  25.59 
 
 
444 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
499 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
418 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  22.22 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
435 aa  84  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  22.54 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.17 
 
 
488 aa  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.75 
 
 
490 aa  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
430 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.38 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 
492 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  27.75 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  28.33 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
512 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
547 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 
505 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 
430 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 
433 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  28.1 
 
 
456 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
546 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
529 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  24.78 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  21.59 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  27.37 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
526 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
482 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  21.59 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  24.01 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 
484 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
539 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
463 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
461 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
484 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.46 
 
 
484 aa  53.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>