150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1353 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 486 aa  973    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  44.97 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  36.4 
 
 		 485 aa  346  7e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  36.88 
 
 		 484 aa  299  8e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  35.61 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  34.2 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  32.5 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  36.03 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 477 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  33.77 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  34.26 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  32.82 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  28.18 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.85 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.01 
 
 		 422 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.2 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  24.8 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  24.8 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.62 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  23.87 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.62 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.62 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  23.87 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  23.87 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.62 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.21 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.11 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 424 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 424 aa  93.6  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 429 aa  86.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  26.96 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.6 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.58 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 535 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 420 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.1 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 511 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 542 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.67 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  24.43 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  17.82 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  19.36 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>