68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1606 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 412 aa  804    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  26.23 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  27.19 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.26 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.94 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  22.46 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.62 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.57 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  19.92 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  20.29 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.1 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  17.82 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 485 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2564  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>