33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1274 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  100 
 
 
399 aa  785    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
482 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 
482 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
488 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
483 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
444 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  32.61 
 
 
517 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.52 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  25.14 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 
494 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
542 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
489 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.61 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  37.78 
 
 
526 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 
490 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>