40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2176 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  100 
 
 		 456 aa  910    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.38 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 449 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  26.83 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  36 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  20.2 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1352  Na+-driven multidrug efflux pump  43.64 
 
 		 303 aa  43.5  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>