86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1069 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  958    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  44.68 
 
 		 523 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 444 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.5 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.15 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  27.91 
 
 		 506 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 482 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.26 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  18.67 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.63 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  22.22 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.4 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  25.09 
 
 		 529 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.93 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  22.26 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  18.26 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 514 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 514 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 583 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 481 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  23.58 
 
 		 463 aa  43.5  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 899 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  24.86 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>