140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0253 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
435 aa  846    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  36.99 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  37.18 
 
 
477 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  35.88 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 
478 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
444 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
488 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
472 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
482 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
426 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
444 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
486 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
446 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
449 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
526 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
529 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.25 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  24.5 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.56 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
486 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
484 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.86 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  27.03 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.47 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  21.71 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  22.51 
 
 
478 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  22.63 
 
 
478 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  21.67 
 
 
473 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
413 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
433 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  23.63 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
491 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 
473 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
458 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  21.62 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.22 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.81 
 
 
517 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
446 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 
465 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
475 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
512 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  27.75 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  18.18 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
480 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  20.76 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
505 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
483 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.01 
 
 
486 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
499 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.12 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 
481 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  20.8 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.45 
 
 
483 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
483 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 
411 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  29.8 
 
 
471 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
453 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 
482 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
483 aa  46.6  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  22.79 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  22.79 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>