154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0621 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
475 aa  933    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.38 
 
 
464 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  25.76 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 
512 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
474 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
504 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
488 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
483 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
501 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
504 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.71 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  20.55 
 
 
483 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  29.02 
 
 
430 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
511 aa  96.7  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  26.99 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.86 
 
 
488 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
482 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
499 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
504 aa  94.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
422 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 
481 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
491 aa  90.1  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 
500 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  26.99 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
511 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
497 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
477 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.44 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  23.92 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  24.23 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  22.17 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
468 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
583 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  30.38 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
440 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 
492 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
499 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  32.41 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
476 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
423 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 
484 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
538 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  33.69 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
505 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
504 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  28.74 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  17.97 
 
 
518 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 
490 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
451 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
429 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
489 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>