40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0336 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  70.26 
 
 		 507 aa  675    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 504 aa  999    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  69.46 
 
 		 504 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  63.24 
 
 		 501 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  70.73 
 
 		 504 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  66.87 
 
 		 511 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  64.21 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  36.7 
 
 		 474 aa  253  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.09 
 
 		 493 aa  159  8e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  30.72 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  27.44 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  31.04 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  27.07 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.53 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.22 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.36 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  22.99 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.37 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 481 aa  53.5  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.84 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>