44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1623 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
489 aa  976    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  30 
 
 
466 aa  193  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 
488 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  28.57 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  27.96 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 
490 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
491 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
496 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
465 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  26.14 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
504 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
461 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
475 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 
501 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  25 
 
 
493 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 
512 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  26.29 
 
 
469 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.69 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
507 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
408 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
483 aa  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
477 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.41 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  26.01 
 
 
493 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>