68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3073 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 491 aa  979    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.67 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.48 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.2 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  19.95 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.41 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  21.19 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 479 aa  57  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.27 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.82 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.42 
 
 		 508 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 446 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 504 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.36 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  19.51 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  22.79 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 408 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.82 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>