80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1684 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
483 aa  936    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  41.44 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  32.16 
 
 
475 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  30.75 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  32.6 
 
 
483 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
476 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 
500 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
489 aa  106  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.81 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.39 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.04 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.92 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
477 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  30.96 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  32 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 
526 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
481 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 
424 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.03 
 
 
485 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 
474 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.93 
 
 
486 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
475 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
500 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 
539 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
483 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
483 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  28.66 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1766  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.44 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.239762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  28.95 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.16 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
422 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  28.71 
 
 
466 aa  47.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
483 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
493 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  24.23 
 
 
510 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.43 
 
 
517 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
446 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.01 
 
 
479 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 
489 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.59 
 
 
493 aa  47  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
489 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  23.85 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  19.7 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
512 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  36.92 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 
519 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 
519 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
484 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 
519 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  27.53 
 
 
456 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
547 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  30.65 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
496 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
482 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>