86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3014 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 422 aa  845    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  25.06 
 
 		 466 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 500 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.79 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  25.55 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  18.51 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  24.22 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  22.27 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  23.04 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  22.42 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  20 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  22.13 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  24.31 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2834  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  18.99 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  21.63 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00202  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  23.15 
 
 		 508 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 472 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.88 
 
 		 470 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1777  hypothetical protein  24.07 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00741649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.58 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  18.9 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.23 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 499 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  21.74 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  22.02 
 
 		 493 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>