57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1162 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  100 
 
 		 466 aa  922    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 489 aa  192  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  25.75 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  22.87 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.77 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  18.7 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.32 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 583 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  25.12 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.91 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 546 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  22.68 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  20.52 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  40.82 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.22 
 
 		 470 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  24.24 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>