89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0123 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
476 aa  941    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
476 aa  941    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  31.22 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  29.54 
 
 
471 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
472 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  28.14 
 
 
481 aa  206  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  27.51 
 
 
475 aa  199  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 
486 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  28.6 
 
 
484 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
474 aa  176  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  31.9 
 
 
472 aa  172  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  26.09 
 
 
478 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 
415 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
483 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  22.71 
 
 
486 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  22.19 
 
 
422 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
484 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.2 
 
 
484 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  21.74 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  21.74 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  21.74 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  22.31 
 
 
422 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  22.31 
 
 
422 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  22.31 
 
 
422 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  22.31 
 
 
422 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
419 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
417 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
417 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
417 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 
433 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.5 
 
 
484 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
484 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
484 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.5 
 
 
484 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.95 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25.32 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  20.36 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
418 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  21.97 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
504 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
421 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
404 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
444 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.8 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 
406 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
488 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
511 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.22 
 
 
490 aa  53.5  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  19.93 
 
 
416 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.45 
 
 
488 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  19.9 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
484 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
478 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2606  hypothetical protein  25.55 
 
 
524 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166267  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  24.79 
 
 
471 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
492 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  20.9 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
509 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
495 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.66 
 
 
466 aa  43.1  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>