23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1481 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 471 aa  910    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.88 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.81 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.2 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.95 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.1 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>