25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0302 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 480 aa  962    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.97 
 
 		 476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  32.61 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.68 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.6 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  19.44 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.56 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 472 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  18.83 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  18.33 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  19.92 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1777  hypothetical protein  21.43 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00741649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>