83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03555 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 461 aa  904    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  54.66 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  50.46 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  40.25 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  40.74 
 
 		 496 aa  309  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  36.11 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  40.72 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  32.57 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  33.49 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  32.31 
 
 		 474 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 507 aa  136  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 511 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 488 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.85 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.11 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.65 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.04 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 500 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.05 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  18.94 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  22.84 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.12 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.05 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2297  MATE efflux family protein  34.21 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.14 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  21.9 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.9 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  21.07 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.9 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.69 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>