35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5446 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 511 aa  1023    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  47.34 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  45.01 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  42.24 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  41.39 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  33.19 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  33.97 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  34.41 
 
 		 493 aa  246  6e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 		 461 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  31 
 
 		 464 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 		 497 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 538 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.03 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  22.22 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  21.15 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>