73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1301 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  97.72 
 
 
483 aa  892    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
483 aa  957    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  96.89 
 
 
483 aa  907    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  48.31 
 
 
467 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  42.05 
 
 
479 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
472 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  26.54 
 
 
461 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 
478 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 
468 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.5 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
475 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
488 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
490 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
474 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.74 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  21.4 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  23.58 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  22.99 
 
 
464 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.83 
 
 
518 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  20.62 
 
 
485 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  23.33 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 
477 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 
500 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 
415 aa  60.1  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 
418 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.37 
 
 
517 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 
480 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
511 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.8 
 
 
488 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
423 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
429 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 
496 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
491 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 
444 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.76 
 
 
476 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
436 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  21.37 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
504 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 
506 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
511 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
444 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
512 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
499 aa  46.6  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
489 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 
503 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
444 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.77 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>