96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4497 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
472 aa  942    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
477 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  23.8 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.61 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  23.42 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  22.62 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
473 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.46 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.76 
 
 
470 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 
488 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  22.68 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
542 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
486 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.68 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 
526 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 
529 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
483 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 
502 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
503 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 
440 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 
415 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
489 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
484 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  20.2 
 
 
490 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 
488 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
498 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
491 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
451 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  19.34 
 
 
464 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 
482 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 
411 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  22.97 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  19.23 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.28 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 
485 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
433 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 
490 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 
432 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.52 
 
 
490 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  23.01 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  21.89 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 
499 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
483 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
483 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  22.88 
 
 
475 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.16 
 
 
422 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 
483 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  22.71 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  19.64 
 
 
489 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
475 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>