36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3265 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 411 aa  797    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  43.8 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  39.55 
 
 		 449 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  38.73 
 
 		 460 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  35.73 
 
 		 438 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  27.75 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.62 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  27.27 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.62 
 
 		 387 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.94 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0975  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.341019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  28.17 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  26.48 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  27.21 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7378  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.17 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 472 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  25.84 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.93 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  26.07 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  29.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  29.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>