20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3640 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 440 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  77.7 
 
 		 449 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  40.49 
 
 		 417 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  38.2 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  38.35 
 
 		 438 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  42.01 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  27.97 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  32.65 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.67 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  22.83 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7378  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.5 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.02 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.96 
 
 		 483 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0975  polysaccharide biosynthesis protein  20.17 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.341019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.93 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>