19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0837 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
460 aa  933    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  38.73 
 
 
411 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  36.56 
 
 
449 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  38.62 
 
 
417 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  37.66 
 
 
438 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  37.47 
 
 
421 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  31.75 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  26.47 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.28 
 
 
387 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
405 aa  87  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  20.25 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
531 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7378  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.7 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.95 
 
 
591 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  31.47 
 
 
491 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
476 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>