14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1443 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  100 
 
 		 419 aa  833    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0975  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.341019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.76 
 
 		 591 aa  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.18 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>