23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0498 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 449 aa  892    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  77.7 
 
 		 440 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  40.62 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  39.55 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  39.68 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  36.56 
 
 		 460 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  27.56 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  30.9 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.54 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1443  polysaccharides export protein  22.9 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.466456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2032  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0688157  hitchhiker  0.000748168 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0999  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7378  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.11 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0415  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 531 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02470  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.41 
 
 		 591 aa  54.3  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.919412  normal  0.0509107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0975  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.341019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.38 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  26.9 
 
 		 860 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 477 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>