75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1392 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1718    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  55.19 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  52.24 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  51.94 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  51.79 
 
 		 349 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  51.19 
 
 		 349 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  37.25 
 
 		 495 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  45.05 
 
 		 341 aa  234  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  39.37 
 
 		 342 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  31.52 
 
 		 340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  27.41 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  29.17 
 
 		 353 aa  118  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  26.58 
 
 		 337 aa  118  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  26.5 
 
 		 337 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  26.18 
 
 		 337 aa  115  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  33.91 
 
 		 329 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  28.05 
 
 		 350 aa  109  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  108  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  32.25 
 
 		 330 aa  101  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  28.16 
 
 		 333 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  25.96 
 
 		 354 aa  92.8  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  34.06 
 
 		 335 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  29.84 
 
 		 353 aa  89  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  25.08 
 
 		 350 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  27.73 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  22.84 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 414 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  26.52 
 
 		 358 aa  77  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  25.71 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 416 aa  72  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 416 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 418 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  28.42 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  23.62 
 
 		 368 aa  63.9  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  28.57 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  23.49 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  25.15 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  27.37 
 
 		 367 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 416 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 416 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 416 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 899 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  22.38 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 446 aa  52  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 416 aa  50.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  21.96 
 
 		 421 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 428 aa  48.5  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  23 
 
 		 374 aa  47.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  25.93 
 
 		 355 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  23.78 
 
 		 355 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.6 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  26.85 
 
 		 381 aa  45.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  20.21 
 
 		 357 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>