30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2496 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
381 aa  756    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  46.61 
 
 
355 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  46.81 
 
 
369 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  36.87 
 
 
357 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  38.83 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  35.09 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  34.86 
 
 
368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  36.73 
 
 
361 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  31.91 
 
 
347 aa  222  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  41.08 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  37.3 
 
 
401 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  36.32 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  30.73 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  32.11 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  32.9 
 
 
363 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  28.83 
 
 
370 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  32.64 
 
 
367 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  33.07 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  26.39 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  23.13 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  27.69 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  22.48 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  24.06 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  24.57 
 
 
349 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  23.81 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  23.87 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  29.52 
 
 
860 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  26.01 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  23.87 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  26.49 
 
 
335 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>