26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4579 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
374 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  76.7 
 
 
401 aa  553  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  46.2 
 
 
355 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  43.31 
 
 
379 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  44.81 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  38.83 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  34.99 
 
 
347 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  38.35 
 
 
355 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  33.72 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  34.71 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  36.29 
 
 
383 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  34.59 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  35.56 
 
 
363 aa  195  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  32.46 
 
 
370 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  31.2 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  28.53 
 
 
374 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  35.11 
 
 
369 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  34.46 
 
 
367 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  28.53 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  22.07 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  21.84 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  20.42 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  27.21 
 
 
342 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  19.22 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  20.89 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  29.59 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>