40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0961 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  96.44 
 
 
337 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  97.03 
 
 
337 aa  675    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  690    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  79.82 
 
 
337 aa  564  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  59.58 
 
 
338 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  29.56 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  30.67 
 
 
340 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  26.57 
 
 
341 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  27.41 
 
 
860 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  25.55 
 
 
335 aa  116  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  27.56 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  29.25 
 
 
333 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  26.35 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  27.54 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  26.25 
 
 
377 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  25.63 
 
 
353 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  27.17 
 
 
349 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  27.17 
 
 
349 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  30.56 
 
 
350 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  27.54 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  25.75 
 
 
358 aa  93.2  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  24.55 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  26.32 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  22.45 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  26.33 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  25.65 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  23.51 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  23.96 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  25.17 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  22.48 
 
 
381 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  20.21 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  23.13 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  20.42 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  20.34 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  20.57 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  25.95 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  22.63 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  19.32 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  20.91 
 
 
383 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  23.4 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>