42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3286 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
355 aa  711    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  75.35 
 
 
369 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  46.61 
 
 
381 aa  317  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  46.2 
 
 
374 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  40.34 
 
 
357 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  51.34 
 
 
379 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  39.31 
 
 
363 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  45.4 
 
 
401 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  39.05 
 
 
368 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  41.74 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  35.07 
 
 
347 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  40.11 
 
 
355 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  32.1 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  27.56 
 
 
374 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  33.24 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  34.44 
 
 
363 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  32.22 
 
 
367 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  31.94 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  21.94 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  21.58 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  26.44 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  22.66 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  24.34 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  22.3 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  26.46 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  23.61 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  24.31 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  25.26 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  24.39 
 
 
860 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  22.46 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  25.09 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  26.21 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  23.13 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  20.74 
 
 
350 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  24.9 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  21.19 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  26.55 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  27.15 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  21.38 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  23.81 
 
 
353 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>