35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5262 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
369 aa  743    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  77.13 
 
 
367 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  54.29 
 
 
363 aa  351  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  49.73 
 
 
383 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  35.09 
 
 
370 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  32.36 
 
 
363 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  29.53 
 
 
374 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  31.81 
 
 
347 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  35.11 
 
 
374 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  36.46 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  35.67 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  28.41 
 
 
361 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  33.24 
 
 
355 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  32.02 
 
 
401 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  27.54 
 
 
357 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  33.07 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  28.24 
 
 
368 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  31.88 
 
 
369 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  28.9 
 
 
344 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  28.76 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  21.49 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  24.32 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  28.42 
 
 
860 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  23.78 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  20 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  25.55 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  26.58 
 
 
335 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  20 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  19.32 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  23.99 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  25.84 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  26.89 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  18.62 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  24.14 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  19.84 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>