39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1140 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
369 aa  736    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  75.35 
 
 
355 aa  521  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  47.34 
 
 
381 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  47.65 
 
 
379 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  44.81 
 
 
374 aa  278  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  37.82 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  40.71 
 
 
357 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  43.72 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  40.53 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  38.58 
 
 
368 aa  262  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  33.24 
 
 
347 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  38.1 
 
 
355 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  33.71 
 
 
344 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  29.89 
 
 
370 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  32.28 
 
 
383 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  26.37 
 
 
374 aa  169  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  32.7 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  31.88 
 
 
369 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  30.68 
 
 
367 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  33.45 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  28.57 
 
 
860 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  27.36 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  22.32 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  22.97 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  24.57 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  22.12 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  24.23 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  26.74 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  22.05 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  23.67 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  25.28 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  22.59 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  26.04 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  25.26 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  23.21 
 
 
338 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  26.13 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  26.67 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  23.69 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  22.22 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>