25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3746 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  750    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  52.94 
 
 
374 aa  388  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  46.15 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  44.02 
 
 
347 aa  293  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  37.53 
 
 
368 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  39.54 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  35.01 
 
 
383 aa  242  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  38.55 
 
 
357 aa  238  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  35.36 
 
 
361 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  36.36 
 
 
367 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  35.09 
 
 
369 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  36.21 
 
 
379 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  36.07 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  34.91 
 
 
355 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  33.33 
 
 
355 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  32.46 
 
 
374 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  32.39 
 
 
401 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  29.89 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  28.83 
 
 
381 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  25.83 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  25.16 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  31.03 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  25.17 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  20.68 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  23.86 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>